该试剂盒是为构建用于新一代测序(illumina 和 MGI 平台)的高质量文库而开发的。该试剂盒需要双链 DNA 片段(钝的和/或粘的)作为 NGS 文库制备的输入 DNA,并兼容酶解法和物理法(超声、雾化等)生成的 DNA 片段。可使用不同类型的索引进行文库复用。
该试剂盒针对不同类型样本的新一代测序(NGS)文库制备进行了优化。大多数 DNA 文库制备都需要将剪切的 DNA 片段连接到文库适配器上,而 DNA 文库制备与 NGS 数据的质量密切相关。借助 BioDynami 独特的 DNA 文库制备技术,该快速简便的试剂盒可在 1.5 小时内完成高质量的 NGS 文库制备,仅需 10 分钟的动手时间
有些基因组区域很难被均匀覆盖,通常会导致这些区域的覆盖率非常低或出现缺口。
典型的困难区域包括
- 高 GC 含量
- 具有二级结构:主要是由于重复序列
- 最糟糕的情况:同时具有高 GC 含量和重复序列。
例如:如上图所示,人类 TERT 基因是最困难的区域之一。NGS 数据显示,BioDynami 试剂盒在覆盖难度极高的人类 TERT 基因区域方面表现最佳。
illumina 平台试剂盒有三种索引类型可供选择:
非索引:文库没有索引。
索引:每个索引引物中都包含一个 6 个碱基的唯一条形码序列。
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