医用软件 GlycoScape™

分子生物分析数据分析

GlycoScape™ 是一款针对糖生物学研究的实时糖肽检索平台。 实时搜库结果可协助用户监控当前仪器及样本状态 缩短时长 数据采集结束即可实时得到搜库结果，省略糖肽样本耗时的搜库环节。 降低成本 仪器运行、相关耗材和样本制备都会产生高额成本，GlycoScape™ 及其运行即结束（ Run & Done ）的功能在确保有效数据的情况下实现成本的节约。 节省机时 GlycoScape ™实时监控仪器状态，确保仪器高效运转。 保护样本 糖肽样本的制备成本高且 过集成 GlycoScape™ 提供的实时糖肽鉴定和智能数据采集，克服数据分析瓶颈。 通用性 Bruker GlycoScape™ 支持目前及以后所有的 timsTOF Pro、timsTOF HT、 timsTOF fleX、timsTOF SCP 和 timsTOF Ultra 平台的数据。GlycoScape™ 集成到 Bruker ProteoScape™ 软件，无需额外支出费用。 4D-糖蛋白质组学 尽管 CCS 维度信息的加入使得数据量增大，GlycoScape™ 仍然可以轻松实现实时糖肽鉴定。GlycoScape™ 利用 GPU 驱动的 ProLuCID 算法进行肽鉴定，并结合我们的 Myriad 算法进行多糖组成分析。 GlycoScape™ 数据查看 从高水平实验信息到目标特定碎片离子谱图，Bruker GlycoScape™ 实现在集成视图中查看数据的全部细节信息。 智能化 - 采集控制 Bruker GlycoScape™ 可以智能化设置糖肽搜库参数，从而在每个样本采集结束时，通过将搜库结果与预设的糖肽鉴定数量标准对比来决定样本队列继续与否。该功能可核验方法的适用性、节省稀有样本、昂贵耗材和机时。 Myriad 工作流程 —— 实时糖肽鉴定 Armony 等人首次在文章中阐述了 Myriad 工作流程（https://doi.org/10.3390/ijms24097869）。该工作流程使用常见的 N-糖片段有效地将糖肽片段谱解卷积为肽和聚糖部分谱图。然后通过专门的实时算法识别每个部分，最后糖肽被 “ 重新组装 ” 。Myriad 工作流程的一个显著优势是它不需要任何糖型数据库，能够识别不在数据库中的糖，并最大限度地减少假阴性。 Myriad 工作流程可以同步跟上 glyco-PASEF® 数据采集的速度，实现与其他糖蛋白组学软件套件相似的性能，并与参考文献数据一致，因为可以即时生成结果，从而大大减少分析时间。 荷兰奈梅亨大学医学中心的 Hans Wessels 博士、Gad Armony 博士、Dirk Lefeber 博士和 Alain van Gool 博士在 Health-Holland（Grant # LSHM21032）的公私合作计划下与布鲁克合作开发了 Myriad 算法。该算法已集成到 GlycoScape™ 中，可为所有 timsTOF 用户提供实时糖肽鉴定。