作为基于序列的微生物鉴定服务 (AccuGENX-ID®) 的补充,我们通过单基因或多基因座序列分型(SLST 或 MLST)提供 菌株分型 ,两者都是精度非常高的基于序列的菌株分型方法。
AccuGENX-ST® 是一种微生物表征过程,利用基于单基因和多基因座序列分型(S / MLST)的成熟、高准确度测序方法将密切相关的微生物在菌株层面加以区分。我们对微生物鉴定标准区域之外的标靶(16S、D2 或 ITS2)进行 DNA 测序,为您提供分辨菌株水平差异和/或相似性的数据。通过确定菌株水平,您可以明确地跟踪污染源,或者只是验证已知的生产菌株。
鉴于这些方法的可重复性已经提高,可以帮助确定您的益生菌菌株是否相同,或者从一个区域回收的分离物是否与另一种分离物相同,这一重要特征可以实现高分辨率,同时对趋势和跟踪项目的可信度比利用基于片段的分析方法更高。
该基础以 DNA 测序结果为基础。
SLST/MLST 数据是在全局范围内跟踪和记录细菌遗传关系的主要资源。
结果很容易编目并作为将来比较的参考。
这些技术具有高度可重复性、明确性和可扩展性。
为了提高分辨率,我们的研发团队研究了每个物种,确定鉴定应用区域之外的基因靶标,这些靶标可以实现亚种或菌株水平的最高分辨度。考虑到每个群组的相关性和进化速度,每个物种的这些基因座的数量和标识各不相同。
如果发生灭菌失败,客户可以向我们发送样品,我们可以协助确定根本原因。我们将首先通过 16S rDNA 测序鉴定分离物。如果 16S 序列不同,您可以确定分离物是不同的菌株。对于具有相同 16S 序列并且可以使用 SLST 或 MLST 完成的分离物,需要进一步表征。该技术旨在提供信息量最大的数据,并能从物种内的所有菌株中获得明确的结果。
我们基于序列的菌株分型可以帮助您绘制微生物环境。我们可以根据在制造环境中发现的微生物创建序列库数据库。遇到污染物时,您可以快速找到您之前发现该特定菌株的位置。这大大减少了确定污染源的时间和成本。