分析LIS RiboPrinter®

数据管理实验室

除了我们的菌株分型服务 (AccuGENX-ST®)，我们还提供自动核糖体分型，用于细菌分离物的菌株级表征（代码：BacRib）。这种基于片段的技术利用限制酶来确定靶标和切割核糖体 RNA 基因（5S、16S、23S 以及包括 Glu-tRNA 的间隔区）的区域，并产生在菌株水平上独一无二的生物 DNA 指纹。这种 DNA 指纹称为 RiboPrint® 图案。 RiboPrinter®系统将 RiboPrint®图案处于固定相似度范围内的样品组合在一起。这些图案可以在彼此之前或之后生成，并用于确定作为跟踪和趋势化项目一部分的分离物之间的相似性水平。我们为每个提交核糖体分型样本的客户构建和维护自定义库。每次客户提交新样本时，都会将其与自定义库中的所有其他先前样本进行比较，并分配给 RiboGroup。 在某些情况下，核糖体分型无效，因为有些物种在 RiboPrinter® 分析的核糖体 RNA 操纵子中几乎没有多样性。在这些情况下，菌株分型和表征（SLST 和 MLST）的基于序列的方法可以提供比自动核糖体分型更高水平的鉴别和可重复性，并应受到格外关注。