具有成本效益的基因表达分析方法
用于筛选项目
早期汇集和批量处理毫不费力地节省时间
可轻松地从几个样本扩展到36,864个样本
QuantSeq-Pool是大型筛选项目中基因表达分析的最佳解决方案,它采用了样品条形码、早期池化和一个反应中最多96个样品的批量处理,提供了一个可轻松扩展至36864个样品的复用工作流程。
高基因链特异性
QuantSeq-Pool保持了超过99.9%的特殊链特异性,可以将读数映射到基因组上相应的链上,从而能够发现和量化反义转录物和重叠基因。
用于基因表达定量的直接计数
每个转录本只产生一个片段;因此,不需要进行长度标准化。这使得基因表达值的测定更加准确,并使QuantSeq成为基因表达研究中微阵列和传统RNA-Seq的最佳替代品。
简单的生物信息学分析
读数映射通过跳过结点检测而得到简化。读数是在转录本的最3′端产生的,那里几乎没有连接点。因此,通过使用Bowtie2而不是TopHat2,可以加速数据处理。
独特的分子标识符
UMIs是QuantSeq-Pool内置的,在协议的第一步就被引入。UMIs有10个核苷酸长,在读数2的开始读出。使用UMI信息来识别PCR重复,消除扩增偏差。
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