具有成本效益的基因组范围内的基因表达分析
每个转录本只产生一个片段,节省测序深度
快速和简单的一体化协议:少于4.5小时
适用于低输入(1纳克总RNA)和FFPE样品
为非生物信息学家提供免费的数据分析管道
提供用于检测PCR重复的UMI
NEW!捆绑有多达384个独特的双指数(UDIs)
QuantSeq FWD Kit是一个文库制备协议,旨在生成Illumina兼容的接近多腺苷酸化RNA 3'端的序列文库。
QuantSeq FWD在第二链合成引物中含有Illumina Read 1连接序列,因此NGS读数是向聚(A)尾部生成的,直接反映了mRNA序列(见工作流程)。这个版本是基因表达分析的推荐标准。Lexogen还提供了一个高通量版本,可选择双索引(i5和i7索引),允许在一个泳道上复用多达9,216个样品。
转录本末端位置的映射
通过使用较长的读数,QuantSeq FWD可以准确地定位聚(A)RNA的3'端(见图3),从而获得关于3'UTR的准确信息。
低输入和低质量样品的分析
推荐的总RNA的输入量低至1纳克。QuantSeq适合从低质量的RNA中重复生成文库,包括FFPE样品。参见图1和图2,对同一样品的两种不同质量的RNA(FFPE和新鲜冷冻的冰块)进行比较。
---