在最新版 Refseq(109,2021)和 CCDS 数据库的基础上,NEXome 核心小组在数据库之外精心挑选了一些值得关注的区域。同时,基于产品连续性的考虑,保留了一些在最新版数据库中删除的区域。NEXome 核心数据库包含约 40 万个单链 DNA 探针,这些探针均由独立合成,并经过独立的质量检测,针对 34.7Mb 的基因组区域(19,613 个基因)。NEXome Core Panel 作为核心全基因组面板,可与不同的 spike-in 面板组合,以满足不同的应用要求。
生产和质量控制
独立合成和独立质量检测
RNA 样品可以直接用于该试剂盒的文库制备吗?
本试剂盒仅适用于 gDNA 或 cDNA 作为初始样本。对于 RNA 样品,在文库制备之前需要反转录生成 cDNA。
建议的输入范围是多少?如何处理超出此范围的输入?
本试剂盒支持 50-2,000 纳克 gDNA 或 cDNA。如果输入量超过 2,000 ng,请将样品分成多个反应以保持扩增效率。
该试剂盒的插入片段大小是多少?如何选择测序读长?
使用本试剂盒的 PCR 产物主峰约为 270 bp。建议使用 PE150 测序,以获得高质量的覆盖率。
IGTR 免疫谱系分析推荐的测序数据量是多少?
建议至少使用 0.3 Gb 的数据量来检测丰度为 0.01%、输入量为 200 纳克的克隆。增加数据量可提高对低频克隆的灵敏度。
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