NEX-t Panel v1.0 从数百种病原体(包括病毒、细菌、真菌和寄生虫)的基因组中筛选出一系列特征序列。它涵盖了丰富的内容,包括 16S/ITS、看家基因、耐药相关基因等。
性能
创新独特的设计
NEX-t Panel v1.0 主要由以下三个部分组成:
(1) 针对数百种物种(包括病毒、细菌、真菌和寄生虫)特征序列设计的探针,如表 1 所列。
对物种或属内的多个参考序列进行比较,选择探针耐受范围内并含有一定多样性的区域。
纳入多焦点序列分型(MLST)所涉及的序列。
整合相关文献。
(2) 为 16S/ITS 设计了一小套通用探针。
参考多个数据库(SILVA,Greengenes,RDP,Unite)
(3) 为抗药性、毒性和相关基因设计的探针。
RNA 样品可以直接用于该试剂盒的文库制备吗?
不能。本试剂盒仅与 gDNA 或 cDNA 作为初始样本兼容。对于 RNA 样品,在文库制备之前需要反转录生成 cDNA。
建议的输入范围是多少?如何处理超出此范围的输入?
本试剂盒支持 50-2,000 纳克 gDNA 或 cDNA。如果输入量超过 2,000 ng,请将样品分成多个反应以保持扩增效率。
该试剂盒的插入片段大小是多少?如何选择测序读长?
使用本试剂盒的 PCR 产物主峰约为 270 bp。建议使用 PE150 测序,以获得高质量的覆盖率。
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