NanOnco Plus Panel v3.0 针对实体瘤研究中感兴趣的 620 个基因(包括 HLA 基因)的完整编码区、一系列与常见融合相关的内含子区、经典微卫星序列和化疗相关多态性位点。该面板共涉及 637 个基因,覆盖基因组约 2.4 Mb 的目标区域。它支持多种变异的富集,包括碱基替换、插入/缺失、基因重排、基因扩增、微卫星不稳定性等。
RNA 样品是否可以直接用于该试剂盒的文库制备?
不能。本试剂盒只兼容 gDNA 或 cDNA 作为初始样本。对于 RNA 样品,在文库制备之前需要反转录生成 cDNA。
建议的输入范围是多少?如何处理超出此范围的输入?
本试剂盒支持 50-2,000 纳克 gDNA 或 cDNA。如果输入量超过 2,000 ng,请将样品分成多个反应以保持扩增效率。
该试剂盒的插入片段大小是多少?如何选择测序读长?
使用本试剂盒的 PCR 产物主峰约为 270 bp。建议使用 PE150 测序,以获得高质量的覆盖率。
IGTR 免疫谱系分析推荐的测序数据量是多少?
建议至少使用 0.3 Gb 的数据量来检测丰度为 0.01%、输入量为 200 纳克的克隆。增加数据量可提高对低频克隆的灵敏度。
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