OncoFu Elite(用于 RNA)Panel v1.0 针对实体瘤研究中最常见或与临床重大融合相关的 105 个基因。探针覆盖了所有转录本编码区和一些涉及融合发生的 UTR 区,这些区域已正式纳入 RefSeq 109。该面板支持在 RNA 水平丰富融合、突变和基因表达信息。
RNA 样品能否直接用于该试剂盒的文库制备?
不能。该试剂盒只兼容 gDNA 或 cDNA 作为初始样本。对于 RNA 样品,在文库制备之前需要反转录生成 cDNA。
建议的输入范围是多少?如何处理超出此范围的输入?
本试剂盒支持 50-2,000 纳克 gDNA 或 cDNA。如果输入量超过 2,000 ng,请将样品分成多个反应以保持扩增效率。
该试剂盒的插入片段大小是多少?如何选择测序读长?
使用本试剂盒的 PCR 产物主峰约为 270 bp。建议使用 PE150 测序,以获得高质量的覆盖率。
IGTR 免疫谱系分析推荐的测序数据量是多少?
建议至少使用 0.3 Gb 的数据量来检测丰度为 0.01%、输入量为 200 纳克的克隆。增加数据量可提高对低频克隆的灵敏度。
该试剂盒是否适用于最小残留病(MRD)监测?
该试剂盒包括 IG 引物混合液和 TR 引物混合液,基因特异性引物分别装在不同的试管中,可在一次扩增反应中灵活组合。
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