GenSearchNGS 是一个集成的软件解决方案,用于分析来自常用 NGS 设备的 DNA-SEQ 数据,如罗氏/454,光照,离子洪流和质子。 它是在与欧洲领先的认证诊断团体密切合作下设计和开发的,并得到 NMDChip FP7 项目的支持。
它集成了从导入和筛选序列读取、条码分割、对齐、变体检测和注释到检测变体的最终报告的所有步骤。 变体可以用各种公共和私人数据源进行注释(Ensembl,阿拉穆特,基因组 Trax,...) 它们可以通过家族研究样本之间的逻辑组合进行筛选。
主要特点:
用户友好的软件,用于在 Windows、Linux 和 macOS 系统上运行的诊断设置中重新平衡 NGS 项目。
连接 *)到变体解释工具和数据库,如:Ensembl,DBSNP,阿拉穆特,克林瓦尔,维基通道,基因本体 *)。
过滤样本之间的变体(例如,多个样本的常见变体或从另一个样本中排除一个样本的变体)。
以患者为中心的数据库系统,用于管理序列数据和验证变体。
可以定制导出数据到您的实验室管理系统。
可能性发布你的变体在克林瓦 *)。
与认证实验室共同开发。
对于大型项目(WS/WGS):可以并行使用多台 PC。
插件技术:与我们的专有或公共算法,如 Bowtie,BWA 或结构匹配。 使用
HPO、OMIM 和孤儿学描述符和代码进行注释和过滤,有助于捕获整个外泌体或整个基因组中的突变。
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