NextGENe软件是分析Illumina® iSeq、Miniseq、MiSeq、NextSeq、HiSeq和NovaSeq系统、Ion Torrent Ion GeneStudio S5、PGM和Proton系统以及其他平台产生的桌面测序数据的完美分析伙伴。
NextGENe软件在Windows®操作系统上运行,它提供了一个生物学家友好的 "点击 "界面。它不需要脚本或其他生物信息学支持,在使用诸如CLC Genomics Workbench、Lasergene's SeqMan Pro等程序以及诸如MAQ & SOAP、Top Hat、BWA & Bowtie等学术软件时通常需要这些支持。
NextGENe软件在一个独立的多应用程序包中采用了独特的平台特定技术。NextGENe软件包含以下的分析模块:
SNP/Indel检测
生殖系
体细胞
外显子组捕获、全外显子组测序(WES)
全基因组测序(WGS)
结构变异分析(包括融合基因检测)
基于家族的和三联体的比较
肿瘤与正常人的比较
拷贝数变异(CNV)检测和类似MLPA的筛选的替代方法
从头组装
转录组;替代剪接分析和转录表达水平
ChIP-Seq、数字基因表达(DGE)、miRNA分析和定量及元基因组学。
NextGENe软件是在生物学家友好的Windows®环境下设计的,大大减少了对额外生物信息学资源和成本的需求。NextGENe软件利用低成本的64位Windows操作系统的硬件。(点击这里了解建议的硬件配置)
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