mRNA 表达水平的测量--无论是通过 Northern 分析、核糖核酸酶保护还是实时定量 PCR--通常都是通过将数据与内部或内源参考基因的数据进行比较来标准化的。β-肌动蛋白和甘油醛-3-磷酸脱氢酶(GAPDH)等管家基因最常用,因为它们的表达水平预计在不同的处理条件下保持不变。遗憾的是,这一假设并不总是有效的,而且仅基于看家基因得出的结果可能会有偏差(Suzuki、Higgins 和 Crawford,2000 年)。更好的方法是使用我们的 qPCR 人类参考 cDNA 对数据进行归一化,这是唯一完全来自人体组织的 cDNA 对照。
qPCR 人类参考 cDNA 是比较不同定量 PCR (qPCR) 实验数据的理想对照。我们的 qPCR 人体参考 cDNA 由从多个不同组织中收集的总 RNA 池制备而成,因此基因覆盖面广,RNA 起始材料的芯片分析表明了这一点。与从细胞系中提取的 RNA 相比,从整个组织中提取的 RNA 和 cDNA 具有更好的基因代表性,且变异较少(数据未显示)。此外,PCR 分析表明,我们的总 RNA 几乎不含基因组 DNA。这样就能更准确地测量转录本的拷贝数。高丰度基因和低丰度基因都有很好的代表性,因此可以为每种 qPCR 检测制备范围广泛的系列稀释标准品。由于 RNA 源是以工业规模制备的,因此参考 cDNA 的批间差异极小。
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