医用软件 Phenoplex™

图像分析可视化导入

随着新的染色技术，如成像质谱仪（IMC™，Standard BioTools）和高倍数荧光板（Akoya PhenoCycler®）拉伸了我们利用空间生物学询问肿瘤微环境的能力，在数据中寻找有意义的差异成为一项挑战。 我们的端到端工作流程可满足您所有的多重图像分析需求，在一个软件中包含所有的步骤： 视觉化 从所有主要的多重图像格式（Akoya Biosciences, Standard BioTools, Lunaphore, Rarecyte, Ionpath, Canopy Biosciences, Olympus, Zeiss等）导入图像。设置用户定义的生物标志物组合的颜色通道组，并在它们之间轻松切换，以快速可视化细胞类型/标志物组和初始图像质量。为单个通道或通道组分配颜色，并审查每个通道以确保其包含良好的数据。在质控步骤中，将个别通道排除在下游分析之外。 组织分类 在任何标记物的组合上使用基于绘画训练的组织分割，以检测样品的形态学区域：肿瘤、基质、坏死、伪影等。利用这些区域来更好地告知免疫和其他细胞群与肿瘤、基质等的关系的定位。进一步将肿瘤划分为子区域，自动排除非相关区域（空白玻片、人工制品等），并在感兴趣的特定区域周围创建边缘，例如，定义入侵的肿瘤前沿。 检测细胞 使用我们预先训练好的基于深度学习的核检测和细胞分割算法，用于荧光（DAPI）和成像质谱（DNA-Iridium通道）。如果你对你的细胞检测有特殊要求、